非政府組織有義務將其資金存入在中央銀行的「統一醫療合作夥伴」單一帳戶內，有助於追蹤資金和審計。另外，也禁止非政府組織僱用年輕的南蘇丹醫療專業人員，因為「已造成南蘇丹醫療專業人員的內部人才外流」。